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L'acide aminé détermine sa direction selon 2 axes presque perpendiculaire entre elles. En regardant le schéma ci-dessous on peut voir les zones d'orientation de directions possibles engendrées par un acide aminé.Ceci est valable pour presque la totalité des acides aminés utilisés au niveau du code génétique, sauf pour l'un d'entre eux dont la structure moléculaire diffère des autres en ayant un axe de rotation en moins, il s'agit de la proline ( voir le tableau de la liste des 20 acides aminés deuxième partie au point 4.3.2 ) .
Ici on parle de zones d'orientation de directions possibles, je dis possible parce qu'il faut tenir compte des groupements radicaux des acides aminés en jeux, qui peuvent causer des encombrements stériques, encombrements stériques laissant supposer selon les déductions de la théorie, jouer un rôle primordial dans les relations entre acides aminés au niveau de l'angle de direction engendré entre 2 acides aminés.
