Modèle Biomathématique de la Traduction de l'ARNm
&
Biomathématique du Cancer.

Michel Dulac
2005


6 - Forme tridimensionnelle versus modèle mathématique ( Qu'est-ce que le modèle mathématique nous permet         d'envisager ) .

Dans ce chapitre, on a parlé de classification d'acide aminé, on a parlé de classification des relations entre acides aminés envisagée sous forme d'angles, puis d'un autre côté, nous avons voulu démontrer, comment à partir du modèle théorique, on a pu regarder sous un nouvel aspect, l'acide aminé, autant du point de vue de sa composition structurale que de sa relation avec les autres acides aminés, mais fait à ne pas oublier c'est que cette nouvelle façon de voir l'aspect des acides aminés ainsi que le type de classification possible déduit à partir de la théorie s'insère directement dans un contexte où le cheminement mathématique entre acides aminés et ADN est possible.C'est-à-dire dans un cheminement où il est possible de stocker une protéine constituée par un langage à 20 chiffres en un langage à 4 chiffres au niveau de l'ARNm ou l'ADN.

Les 400 possibilités d'angles, issues des couples d'acides aminés, requises au niveau de la formation d'une protéine d'un côté et du storage de la forme tridimensionnelle d'un autre côté prennent existence avec l'utilisation de la base 21, et ces 400 possibilités de couples différents peuvent être codées en un message à 4 lettres, c'est ce que permet le modèle mathématique développé dans cet ouvrage.

J'ai tenté de démontrer dans ce chapitre, qu'à partir des 20 acides aminés et de leurs structures, on peut entrevoir ou déceler les paramètres dont a besoin la théorie afin de prendre appui à partir des constituants de départ c'est-à-dire les acides aminés.Le processus mathématique développé dans cet ouvrage permet une logique de storage de la forme tridimensionnelle, de l'acide aminé à l'ADN, ce que la compréhension du code génétique actuel ne permet pas. Grâce à ce système mathématique la forme tridimensionnelle peut-être stockée mathématiquement dans l'ADN.Le modèle mathématique nous fait voir aussi que la séquence primaire située au niveau des acides aminés jouerait un rôle de premier plan dans l'élaboration de la forme tridimensionnelle dû aux 400 angles générés par les 400 couples d'acides aminés à partir de la classification des acides aminés de 1 à 20 .

D'après les tables d'ARNm dont on en verra l'utilité plus tard, ( table servant à bâtir l'ARNm à partir des acides aminés ) on verra que pour atteindre un acide aminé voulu le choix des codons tout au long de la construction s'avère important, car pour chacune des tables( variations en fonction des restes ) il y a des valeurs non atteignables mais dépendant de la table choisie en fonction du reste, ces valeurs peuvent devenir atteignables. Nous verrons à ce problème plus tard. Si à partir des tables on effectue une bonne construction du gène alors le message du gène c'est-à-dire de l'ADN à l'acide aminé reste valable dans le sens inverse.

Ce qui a motivé mon choix pour les angles, c'est de la façon dont est construit un acide aminé. Muni de 2 axes de rotation , l'acide aminé permet un cheminement de direction tridimensionnelle ( voir le schéma du point 5.1.1a ) il y a le fait aussi de la classification des 20 acides aminés et des couples d'acides aminés, classification issue de la théorie qui en relation avec la façon dont est bâti un acide aminé semble jouer en faveur des angles . Une protéine de toute façon repose sur un cheminement tridimensionnel imposé par les acides aminés entrant dans sa composition, alors il semble logique que les angles jouent un rôle de premier plan, ce que le modèle mathématique appuie fortement.






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